(1)2001年获中国国家自然科学进步奖二等奖;
(2)2004获美国宇航局局长签署的“Cluster 科学作出突出贡献”证
(3)2005获欧洲空间局特殊贡献奖;
(4) 2004、2007年欧洲空间局探测计划科学成果的重要进展;
(5)研究成果《揭示太空杀手电子形成的秘密》入选美国著名的《发现》(Discover)杂志 2007年度的全球百大科技进展;
(6)2009年欧空局公布了双星-Cluster计划实施中具有突出贡献的十位科学家名单,宗秋刚教授在全世界1000多名科学家中位居第一。
(7)2010年,获得欧空局“杰出科学家”奖。
(8) 2012年美国地球物理协会优秀评审员
(9)2013年永利集团优秀教师奖(方正)
(10) 2015年教育部自然科学二等奖